Kodėl naudojame Sangerio seką?
Kodėl naudojame Sangerio seką?
Anonim

Sangerio sekos nustatymas yra veiksmingas variantų atrankos tyrimų metodas, kai bendras mėginių skaičius yra mažas. Atrankos variantų tyrimams, kai imties skaičius yra didelis, amplikonas sekos nustatymas su NGS yra efektyvesnis ir ekonomiškesnis.

Panašiai galite paklausti, koks yra Sangerio sekos tikslas?

Sangerio sekos nustatymas yra grandinę baigiančių dideoksinukleotidų selektyvaus įtraukimo į DNR polimerazę procesas DNR replikacijos in vitro metu; tai plačiausiai naudojamas SNV aptikimo metodas.

Taip pat žinokite, kodėl ddNTP naudojami Sangerio sekoje? Dideoksinukleotidai yra grandinės pailginimo inhibitoriai DNR polimerazė, naudojamas viduje konors Sangeris metodas skirtas DNR sekos nustatymas . Taigi šios molekulės sudaro dideoksi grandinės nutraukimo metodo pagrindą DNR sekos nustatymas , apie kurį pranešė Frederikas Sangeris ir jo komanda 1977 m. kaip ankstesnio darbo pratęsimas.

Taip pat paklausta, kodėl NGS yra geresnis už Sangerį?

Sangeris sekvenavimas vienu metu gali sekti tik vieną fragmentą. Nes NGS naudoja srauto ląsteles, kurios gali surišti milijonus DNR gabalėlių, NGS gali skaityti visas šias sekas vienu metu. Dėl šios didelio našumo ypatybės labai ekonomiška, kai nustatoma didelė DNR seka.

Ko reikia „Sanger“sekos nustatymui?

Ingredientai, skirti Sangerio sekos nustatymas Jie apima: A DNR polimerazės fermentas. Gruntas, kuris yra trumpas viengubo gabalas DNR kuris susiejamas su šablonu DNR ir veikia kaip polimerazės „užvedimas“. Keturi DNR nukleotidai (dATP, dTTP, dCTP, dGTP)

Rekomenduojamas: